Uživatelské nástroje

Nástroje pro tento web


workshopy:guyton

Guytonův model

Guyton 1972-73

Guyton 1986/88

GUYTON 1992

Guyton memory workshop

V roce 2007 je 35. výročí opublikování Guytonova legendárního čláku.

Cílem workshopu je příprava publikace o starém Guytonově modelu realizovaném v Simulinku.

Chyby v originálním schématu Guytonova modelu

Tlmivy clen

–> Pro Jirku: Ahoj, tady posilam upraveneho Guytona, je tam trochu lepe vyresena ta kvadraticka fce a je to graficky upravene, aby ta kabelaz nevypadala tak hrozne. Az se k tomu zase dostanu, zkusim dodelat i to schema bez pouziti blocku. Kdyby neco, napis primo tady, nebudu porad na mobilu. Honza

zazipovaný UPRAVENÝ Guytonův starý model v simulinku

—> pro Honzu: v gifu i v modelu jsem opravil chybu v popisu bylo KIDNEY NON-MUSCLE OXYGEN DELIVERY, má to býd bez toho Kidney, Honzo, chybí ještě obrázek do masky bloku 87 (PTS) a 164 (AMP)

zazipovaný celkový model a jeho schéma v .gif

Obrázky ke spline funkcím

Tady prikladam upravene uzly, mozna tam jeste nekde najdes nejaky uzel co nesedi, je toho hodne a da se to lehce prehlednout

Guytonuv model

Pro Honzu: → Vyřešena nestabilita v bloku Non Muscle Oxygen Delivery a v bloku Non Muscle Local Bloobood Flow Control, který je možné bez obav propojit - model je teď dostatečně stabilníVýsledky oprav bloků nesvalového kyslíku jsou zde

Dále jsem upravil obrázky v maskách funkčních bloků, místo externích obrázku je lepší udělat křivky pomocí skriptu přímo v masce - lépe se to pak vykresluje při tisku.

popis modelu z roku 1986 - editovatelný wordovský dokument

Článek a odkazované přílohy pro časopis Československá fyziologie

stara verze guytonoldmodeall3.zip Poslední (opravená) verze Guytonova modelu z roku 1972 v Simulinku plus obrázek v pdf (verze 3)

Obrázek - schéma Guytonova modelu z roku 1972 Článek poslaný do redakce ČS Fyziologie

Pro Jirku: → Ahoj, článek sem pročetl a je to moc hezky napsané. Pokud si ho ještě neposílal, tak sem opravil překlepy, odsadil odstavce a upravil kurzívou formát literatury (tak se to tuším dělá podle normy, ale to je opravdu jenom detail, kdyby náhodou). Když tak to tady přikládám zabalené. Článek do redakce ČS Fyziologie

Definitivní podoba článku - 2. číslo Československé fyziologie

takto článek vyšel

Další úkoly - rozpracujme jeho anglickou verzi, v ní navrhuji se dále o genezi a dalších osudech Guytonova modelu, více o chybách ve schematu, zmínit se o Colemanove Humanu z konce osmdesátých let a o QCP z roku 2005 a QHP z letoška. Osud a úloha velkých modelů pro výukové simulátory. O naší metodologii jen stručněji - spíše do dalšího článku.

Článek a odkazované přílohy pro časopis ADVANCES IN PHYSIOLOGY EDUCATION

Článek a odkazované přílohy pro Technical Computing Prague 2007

Nejnovejsi verze modelu Guytona72 s instrukcemi pro Jirku

Snad posledni uprava modelu :o) Bohužel není :-(

<- ještě opraveno pár drobností a přidán seznam proměnných

LOL V článku chci popsat ještě návaznost na další vývoj - proto je potřeba starý Guytonův model převést do simulačních čipů (pro další obrázek do článku) - a pak v článku můžeme odkázat i na strukturu Guytonova-Colemanova složitějšího modelu sestaveného o čtrnáct let později v roce 1986 (který ovšem Coleman mastil ve Fortranu a struktura fyziologických vazeb vynikne právě když je převeden do Simulinku a do simulačních čipů, což už máme hotovo. Na převedení modelu z roku 1986 do Simulinku jsem strávil dost času a v článku je příležitost to „prodat“).

<-starý guytonův model v simulačních čipech - začátek, pouze čip NON-MUSCLE OXYGEN DELIVERY, je potřeba do simulačních čipů převést ostatní bloky dle tohoto vzoru

Guytonova schema slozene ze subsystemu

⇒ pro Jirku: Tak model ze subsystemu je hotovy. Jestli budes mit jeste cas, tak se zkus podivat na nejake upravy, nekde mozna uplne nesedi masky, ja uz to nestiham, ale jinak by to melo byt snad ok. Jinak teda algebraicke smysky ty subsystemy neopravily. Ale je to o dost prehlednejsi. Tak snad se to stihne zitra odeslat.

Pozn.: Snazil sem se jeste prijit na to, proc je to tak zpomalene. Prisel sem na to, ze pricinou nejsou ty displeje, ale je to blok Cirulatory dynamics. Kdyz ho odstranis, tak vsechno bude slapat rychle jako to puvodni schema. I kdyz sem ho pustil samo o sobe, tak je dost pomale. Tak sem jeste zkousel, cim to muze byt, a vypada to, ze kdyz treba snizis pocet vstupu, vystupu z toho bloku, tak se ta rychlost zvysuje. Coz mi teda nijak extra logicke neprijde, ale vypada to, jako by to zatezoval ten subsystem, ze ma moc vstupu/vystupu. Kdyz se pusti sam o sobe, tak je rychly stejne, proto asi to puvodni schema slape rychle. Nevim jestli by pomohlo ten blok rozdelit na 2 mensi, ale aspon u tohohle modelu by to ztracelo pak vyznam. Zkusil sem si pustit ten novejsi model z 86-ho co si delal, a ten jede taky docela pomalu. Je to zajimave, ale pri pouziti tech bloku to strasne klesa na vykonu, si to nejak prepocitava, nebo buhvi v cem je problem. Takze chybu bych mozna hledal nekde spis tam, jestli se s tim neda neco udelat. Protoze principielne je to jen navesti, to by vubec zatezovat nemelo.

Honzo, zkusime se poprosit o radu tÿ hochy z Humusoftu - dame to tam zatim tak jak to je, az to bude vystavene na webu, tak to upravime. JK

Příčina zpomalení modelu dle Honzy Houšky z Humusoftu

Ahoj,

pricina ruzne rychlosti je, ze ty modely maji nastavenou ruznou simulacni metodu. GuytonModel1972 ma metodu ode23tb, ktera je urcena pro stiff systemy a je pomerne rychla, i kdyz nekdy trochu na ukor presnosti. GuytonModel1972WithSubsystems ma metodu ode45, ktera je hodne presna, urcena pro libovolne systemy, ale nekdy trochu pomalejsi. GuytonModel1986 pak ma nastavenou metodu s pevnym krokem ode4, ktera je pro dany ucel zcela nevhodna.

Jestlize ten system je stiff (jako ze asi je), doporucuju pouzit bud tu ode23tb, nebo ode23t, nebo ode15s. Zkus je porovnat z hlediska presnosti a rychlosti a vyber tu nejlepsi. Co se presnostu tyce, muzes jako referenci pouzit vysledky z metody ode45. Te to sice dlouho trva, ale presnost bude mit asi nejlepsi a muzes ji brat za spravnou a vuci ni porovnavat vysledky tech rychlejsich stiff metod.

Kdyz se vsem trem modelum nastavi stejna integracni metoda, je jejich rychlost srovnatelna bez ohledu na subsystemy - coz je tak, jak by to melo byt.

Ahoj Honza

Definitivní text poslaný na konferenci:

Článek Technical Computing Prague 2007

Publikace

Kofránek Jiří, Rusz Jan: Restoration of Guyton's diagram for regulation of the circulation as a basis for quantitative physiological model development. Physiological Research 59,897-908,2010

Marek Mateják and J. Kofránek (2010). "Rozsáhlý model fyziologických regulací v Modelice." MEDSOFT 2010: 126-146.

Mateják, M., et al. (2009). "Akauzální" vzkříšení" Guytonova diagramu." Medsoft 2009: 105.

Jiří Kofránek, Jan Rusz, Statislav Matoušek: Vzkříšení Guytonova diagramu - od obrázku k simulačnímu modelu. In MEDSOFT 2008, Agentura Action M, ISBN 978-80-86742-22-9, Praha 2008, str. 57-62

workshopy/guyton.txt · Poslední úprava: 2014/01/29 22:40 autor: marek